Penelitian adalah satu pilar pengembangan keilmuan bagi Program Studi Pedidikan Geografi UNY. Sejalan dengan hal tersebut, budaya penelitian kuat dikembangkan dalam keseharian mahasiswa PGPM. Penelitian mahasiswa ini pada akhirnya juga diarahkan menjadi luaran dalam bentuk karya ilmiah serta tesis dan skripsi. Proyek dilaksanakan dalam bentuk penelitian payung dengan satu tema mayor, dan menurunkan banyak tema minor yang dikemas menjadi tugas akhir tesis dan skripsi.